Сайты
Сайты, здесь вы создаете сайты, каждый сайт это независимый объект в системе и не обязательно равен вашему сайту, он всего лишь группирует товары вокруг себя, далее вы поймете как этим пользоваться. Идём в раздел сайты и нажимаем кнопку добавить сайт:

Здесь вы задаете название, по которому вы поймете, что это за сайт и домен. Причем домен это не в прямом смысле домен, он ни где не фигурирует в экспорте, но идентифицирует объект, например, если вы создаете сайты на нескольких языках, настройка будет такого вида:
сайт Россия - site.ru
сайт Германия - de.site.ru
сайт США - site.ru/en
т.е. мультиязычные сайты, сайты отдельных подразделений, отдельных направлений и вообще как угодно, на что хватит фантазии. Возникает вопрос, почему это не сделать в одном сайте? Потому что мы делаем правильно. Когда вы столкнетесь хотя бы с тремя языками, вы поймете почему.
Настройки SLUG (URL)

Настройки для генерации SLUG (URL, ЧПУ). Так как в разных системах управления контентом обычно функции генерации ЧПУ дают разный результат и если вы перенесите товары в другую систему, то адреса страниц могут оказаться разными. Просто используйте ЧПУ из одной системы и такой проблемы у вас не возникнет. Есть несколько вариантов правил генерации ЧПУ товаров, можно использовать различные шаблоны. Нужно обратить внимание на то, что slug генерируется только если поле не заполнено, таким образом, вы можете импортировать slug для существующих товаров, если требуется изменить slug у существующих товаров, то необходимо очистить поле, после этого slug будет сгенерирован заново. Для каждого сайта свои настройки.
Точно такие же настройки и для категорий. Здесь только нужно уточнить:
- Если правила для категорий не заданы, то будут использоваться такие же как в товарах.
- Одинаковый SLUG может быть у разных категорий, но не может быть у категорий с одним родителем, иначе в одном разделе будет несколько категорий с одним и тем же URL и это не правильно. Поэтому и при перемещении категорий, если она будет перемещена в ту родительскую категорию, в которой есть дочерние с таким же SLUG, вам придется изменить его, для избежания этой проблемы. Вообще старайтесь использовать генерацию так, чтобы повторений не было, это упростит вам жизнь.
Далее сохраняете свой сайт и приступаете к следующему шагу. Так или иначе, нужно откуда то импортировать товары, поэтому переходим в раздел правила импорта.